تعیین ویژگی های ژنوم و دامنه میزبانی ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی در جنوب و جنوب شرق ایران

thesis
abstract

چکیده بیماری پیچیدگی (زرد) برگ گوجه فرنگی[tomato (yellow) leaf curl virus, t(y)lcv] از گسترده ترین و مخرب ترین ویروس های گوجه فرنگی است که توسط چندین ویروس نزدیک به هم ایجاد می شود. این ویروس ها از خانواده geminiviridea و جنس begomovirus می باشند. ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی (tomato leaf curl palampur virus, tolcpmv) یکی از گونه های جدید جنس بگوموویروس است که اخیرا از کشورهای هند و ایران روی گوجه فرنگی گزارش شده است. به منظور تعیین مشخصات ژنوم و دامنه میزبانی tolcpmv در استان های کرمان و هرمزگان طی سال های 87-86 تعداد 233 نمونه گیاهی از مزارع و گلخانه های کدوئیان جمع آوری شد. بررسی نمونه های فوق با استفاده از آغازگر های عمومی واختصاصی در آزمون pcr نشان داد که کدوئیان از جمله خیار، کدو، طالبی، شما و خربزه آلوده به tolcpmv هستند. برای تعیین مشخصات ژنوم، قطعات dna-a و dna-b توسط آغازگرهای اختصاصی تکثیر و محصولات pcr بعد از همسانه سازی تعیین ترادف گردیدند. نتایج حاصل از تعیین ترادف قطعات dna-a و dna-b نشان داد که طول کامل این دو قطعه به ترتیب 2756 و 2720 جفت باز بوده و هر قطعه به ترتیب دارای شش و دو چهارچوب بسته ژنی (orf) می باشند. براساس مقایسه ترادف نوکلئوتیدی بیشترین شباهت طول کامل قطعات dna-a و dna-b ویروس جدایه ایرانی ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی با tolcpmv-in که اخیرا از کشور هند گزارش شده است، به ترتیب 97 و89 درصد می باشد. از میان سایر بگوموویروس های دیگر، جدایه ایرانی tolcpmv بیشترین شباهت را با جدایه های ویروس نیودهلی پیچیدگی برگ گوجه فرنگی (tomato leaf curl new delhi virus, tolcndv) نشان داد. بر اساس مطالعات فیلوژنتیکی، جدایه ایرانی tolcpmv با جدایه هندی ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی و جدایه های مختلف tolcndv در یک گروه قرار می گیرند. نتایج حاصل از این تحقیق نشان می دهد که tolcpmv در مزارع کدوئیان و گوجه فرنگی در مناطق جنوب و جنوب شرقی ایران به طور گسترده شیوع دارد، بطوریکه خسارت ناشی از این ویروس در برخی از مزارع و گلخانه های کدوئیان به 100% می رسد. در خاتمه می توان گفت که ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی یک تهدید جدی برای کاشت بسیاری از انواع کدوئیان و گوجه فرنگی در مناطق جنوب و جنوب شرق ایران است.

similar resources

ساخت سازه عفونت‌زا و اثبات بیماری‌زایی ژنوم دو بخشی ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی- جدایه ایران

به منظور اثبات بیماری‌زایی و تعیین میزبان‌های آزمایشگاهی جدایه ایرانی ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه‌فرنگی (Tomato leaf curl Palampur virus-IR, ToLCPMV-IR)، سازه‌های دوپار به‌طور مستقل برای هر کدام از قطعات ژنومی A و B ویروس، طراحی و داخل ناقل دوگانه pGreen0029 قرار داده شد. هر دو به‌طور جداگانه به همراه پلاسمید کمکی pSoup به سلول‌های باکتری Agrobacterium tumefaciens نژاد C5...

full text

مقایسه دامنه میزبانی طبیعی و آزمایشگاهی ویروس‌های پیچیدگی شدید و ایرانی بوته چغندرقند و ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی

جدایه ایرانی ویروس پیچیدگی شدید بوته چغندرقند (BSCTV-IR) و ویروس ایرانی پیچیدگی بوته چغندرقند (BCTIV)، به ترتیب از جنس‏های Curtovirus و Becurtovirus به عنوان عوامل بیماری پیچیدگی بوته چغندرقند از ایران گزارش شده‏اند. علاوه بر چغندرقند، گوجه‏فرنگی و فلفل از مهم‏ترین میزبان‏های اقتصادی این ویروس‏ها محسوب می‏شوند. بیماری پیچیدگی برگ گوجه‏فرنگی از مهم‏ترین بیماری‏های ویروسی گوجه‏ف...

full text

خصوصیات مولکولی و ساخت همسانه عفونت‌زای یک سویه جدید ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی در جنوب ایران

ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل یک همسانه عفونت‌زای جدایه آباده ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی (TYLCV-[Ab]) تعیین شد. ژنوم کامل این ویروس با 2782 نوکلئوتید بیشترین میزان شباهت (95%) را با یک جدایه TYLCV از اسرائیل نشان داد. بدین ترتیب TYLCV-[Ab] یک استرین جدید از TYLCV</st...

full text

ساخت سازه عفونت زا و اثبات بیماری زایی ژنوم دو بخشی ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی- جدایه ایران

به منظور اثبات بیماری زایی و تعیین میزبان های آزمایشگاهی جدایه ایرانی ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه­فرنگی (tomato leaf curl palampur virus-ir, tolcpmv-ir)، سازه های دوپار به طور مستقل برای هر کدام از قطعات ژنومی a و b ویروس، طراحی و داخل ناقل دوگانه pgreen0029 قرار داده شد. هر دو به طور جداگانه به همراه پلاسمید کمکی psoup به سلول های باکتری agrobacterium tumefaciens نژاد c58 منتقل و به چند می...

full text

بررسی ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی در استان بوشهر

گوجه‌فرنگی یکی از سبزیجات مهم و بیماری پیچیدگی برگ زرد گوجه‌فرنگی از مهمترین بیماریهای گوجه‌فرنگی در سراسر دنیاست. طی فصل‌های زمستان 1391 و بهار 1392، به منظور بررسی ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی در استان بوشهر از مزارع کشت گوجه فرنگی واقع در شهرستانهای تنگ ارم، دشتستان و چند بخش مربوط به آن از گیاهان مشکوک به آلودگی نمونه برداری شد. پس از استخراج DNA، واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از آ...

full text

میزبانان طبیعی و پراکنش ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی در ایران

ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی (tomato leaf curl palampur virus,tolcpmv) متعلق به خانواده geminiviridae و جنس begomovirus بوده و در سال های اخیر باعث خسارت های گسترده به گوجه فرنگی و انواع کدوئیان در مناطق جنوبی و جنوب شرقی ایران شده است. به منظور مطالعه گسترش tolcpmv در ایران، شناسائی میزبانان طبیعی و بررسی تنوع ژنتیکی آن، در طی سال های 89-1387 نمونه برداری از گلخانه ها و مزارع کشت انوا...

15 صفحه اول

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023